MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 6898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021082	TC	3	6	21	26	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021082	T	6	6	50	55	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021082	TAA	2	6	75	80	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021082	AAT	2	6	82	87	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021082	CAA	2	6	2579	2584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021082	A	6	6	2583	2588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021082	TGAT	2	8	2592	2599	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021082	AAAG	2	8	6754	6761	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021082	TAG	2	6	6762	6767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021082	ATT	2	6	6783	6788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021082	A	6	6	6833	6838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021082	T	7	7	6875	6881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021082	TAT	2	6	8304	8309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021082	ATTT	2	8	8393	8400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021082	TAA	3	9	9608	9616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021082	ACA	2	6	9619	9624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021082	A	6	6	9640	9645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021082	ATT	2	6	12473	12478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021082	TAA	2	6	12493	12498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021082	TAAAT	2	10	12501	12510	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021082	ACT	2	6	18399	18404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021082	A	6	6	18418	18423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021082	TCT	2	6	18574	18579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021082	T	6	6	18624	18629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021082	AAAT	2	8	18653	18660	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021082	TTA	2	6	18734	18739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021082	T	7	7	18754	18760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021082	A	6	6	18817	18822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021082	TAAT	2	8	19474	19481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021082	TCGC	2	8	19508	19515	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021082	A	7	7	19563	19569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021082	TGAT	2	8	21253	21260	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021082	A	6	6	21295	21300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021082	AGT	2	6	21320	21325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021082	T	7	7	21341	21347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021082	T	6	6	21383	21388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021082	AAT	2	6	21390	21395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021082	TTAA	2	8	21407	21414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021082	TAT	2	6	21420	21425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021082	ATA	2	6	21466	21471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021082	T	6	6	24941	24946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021082	TAT	2	6	25939	25944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021082	T	6	6	25944	25949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021082	TAAA	2	8	25959	25966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021082	A	8	8	25964	25971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021082	ATA	2	6	25996	26001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021082	ATTT	2	8	26034	26041	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021082	ATG	2	6	26061	26066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021082	ACTAG	2	10	26092	26101	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_021082	T	7	7	26176	26182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021082	A	7	7	26189	26195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021082	TAT	2	6	26222	26227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021082	T	6	6	26255	26260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021082	TAT	2	6	26278	26283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021082	AAT	2	6	26327	26332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021082	A	6	6	28728	28733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021082	CTGCT	2	10	28744	28753	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_021082	TCAC	2	8	29998	30005	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021082	AAG	2	6	30089	30094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021082	TCT	2	6	30101	30106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021082	CCA	2	6	31630	31635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_021082	TAA	2	6	31643	31648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021082	A	7	7	31695	31701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021082	AAT	2	6	33778	33783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021082	T	7	7	33794	33800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021082	TAA	2	6	34402	34407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021082	TAA	2	6	34413	34418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021082	T	6	6	34512	34517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021082	A	6	6	34556	34561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021082	GTG	2	6	34569	34574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021082	TTAA	2	8	34598	34605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021082	GTTA	2	8	34617	34624	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021082	TGAT	2	8	34641	34648	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021082	TA	3	6	34699	34704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021082	A	7	7	37943	37949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021082	TCA	2	6	40625	40630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021082	AGTTTA	2	12	41187	41198	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021082	ATC	2	6	41282	41287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021082	TCT	2	6	41333	41338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021082	A	7	7	41366	41372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021082	TC	3	6	42022	42027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_021082	CTTA	2	8	44733	44740	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021082	T	6	6	45658	45663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021082	CT	4	8	45680	45687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021082	CGCT	2	8	45734	45741	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021082	GA	3	6	45798	45803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021082	ATT	2	6	45809	45814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021082	TTC	3	9	45854	45862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021082	AGA	2	6	45867	45872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021082	AAT	2	6	47134	47139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021082	T	6	6	47150	47155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021082	A	7	7	47158	47164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021082	AAT	2	6	48779	48784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021082	CTT	2	6	50246	50251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021082	AATTA	2	10	50258	50267	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021082	TGA	2	6	50377	50382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021082	AATA	2	8	51393	51400	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021082	AT	3	6	51432	51437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021082	CT	3	6	52566	52571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021082	AGA	2	6	52605	52610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021082	TC	3	6	52670	52675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021082	AAG	2	6	52685	52690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021082	TAA	2	6	53314	53319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021082	TTA	2	6	53392	53397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021082	TAAA	2	8	54358	54365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021082	TAA	2	6	54385	54390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021082	A	7	7	54439	54445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021082	AATT	2	8	54480	54487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021082	ATT	2	6	57446	57451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021082	TAA	2	6	57485	57490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021082	TGTCT	2	10	57566	57575	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_021082	ATCA	2	8	57591	57598	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_021082	TGT	2	6	57747	57752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021082	AATGAA	2	12	57765	57776	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021082	AAT	2	6	57793	57798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021082	A	7	7	57853	57859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021082	TAT	2	6	58797	58802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021082	TGA	2	6	59690	59695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021082	A	6	6	59725	59730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021082	T	7	7	61254	61260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021082	TA	3	6	61266	61271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021082	A	6	6	61298	61303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021082	TAA	2	6	62734	62739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021082	TA	3	6	62750	62755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021082	T	6	6	62796	62801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021082	AGG	2	6	62848	62853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021082	GTTTT	2	10	65499	65508	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021082	AAT	2	6	65534	65539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021082	A	6	6	65563	65568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021082	TAAA	2	8	65586	65593	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021082	GAA	2	6	67139	67144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021082	CTTT	2	8	71026	71033	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_021082	AGTGAC	2	12	71049	71060	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_021082	TAAT	2	8	71077	71084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021082	A	6	6	76252	76257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021082	TAC	2	6	77325	77330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021082	CT	3	6	78829	78834	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_021082	GA	4	8	78845	78852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021082	AG	4	8	78884	78891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021082	TA	3	6	78894	78899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021082	T	6	6	84194	84199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021082	T	6	6	84237	84242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021082	A	7	7	84265	84271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021082	TA	3	6	84281	84286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021082	TG	3	6	84303	84308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021082	TGG	2	6	86045	86050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021082	CATGC	2	10	86082	86091	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_021082	AAT	2	6	86134	86139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021082	CAAG	2	8	86174	86181	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_021082	TTGA	2	8	86185	86192	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021082	AGG	2	6	87851	87856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021082	CAC	2	6	87885	87890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_021082	GTT	2	6	87908	87913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021082	AGG	2	6	87975	87980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021082	CAC	2	6	88009	88014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_021082	AGG	2	6	88103	88108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
157	NC_021082	CAC	2	6	88137	88142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_021082	AGG	2	6	88227	88232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_021082	CCA	2	6	88260	88265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_021082	TAA	2	6	88304	88309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_021082	AAAT	2	8	88338	88345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_021082	ATT	2	6	89925	89930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021082	AAT	2	6	89973	89978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_021082	ATT	2	6	89992	89997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_021082	A	7	7	90002	90008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_021082	TTTA	2	8	90137	90144	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_021082	CAC	2	6	90371	90376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
170	NC_021082	T	7	7	90486	90492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_021082	AATA	2	8	90504	90511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_021082	A	6	6	90533	90538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_021082	T	6	6	90548	90553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_021082	TTGTG	2	10	91150	91159	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
175	NC_021082	T	6	6	91209	91214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_021082	ACC	2	6	92080	92085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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178	NC_021082	T	6	6	92708	92713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_021082	T	6	6	92719	92724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_021082	GAA	2	6	94095	94100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_021082	A	6	6	95317	95322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_021082	TAAA	2	8	95365	95372	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_021082	TCG	2	6	95380	95385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_021082	T	6	6	96187	96192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_021082	A	6	6	96210	96215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_021082	TTA	2	6	96216	96221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_021082	AAAAC	2	10	96230	96239	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
190	NC_021082	TAAC	2	8	99108	99115	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
191	NC_021082	T	6	6	99136	99141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_021082	GCTT	2	8	99155	99162	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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196	NC_021082	T	6	6	101410	101415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_021082	AGGGG	2	10	103938	103947	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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221	NC_021082	CT	3	6	115270	115275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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234	NC_021082	A	6	6	118630	118635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
235	NC_021082	T	6	6	118677	118682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_021082	AGACT	2	10	125562	125571	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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272	NC_021082	TGA	2	6	130585	130590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_021082	TA	3	6	130731	130736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_021082	CAA	2	6	130747	130752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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277	NC_021082	TAAACT	2	12	130804	130815	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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280	NC_021082	T	6	6	131062	131067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_021082	TAG	2	6	133659	133664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_021082	A	7	7	133682	133688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_021082	TCTA	2	8	133713	133720	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
287	NC_021082	TAA	2	6	134238	134243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_021082	A	6	6	134721	134726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_021082	TAA	2	6	134779	134784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_021082	A	6	6	136225	136230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_021082	T	6	6	136277	136282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_021082	AAATG	2	10	136296	136305	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_021082	GA	4	8	211782	211789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
466	NC_021082	AG	4	8	211821	211828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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486	NC_021082	A	7	7	217543	217549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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